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  • Algorithms
  • bioinformatics
  • 杂文
  • 2023

    • 12-10 17:33:22
      评价类模型——层次分析法AHP

      一、层次分析法(原理)1.权重表各指标和为1、某指标下各对象和为1 2.指标/目标对象的确定(检索)尽量有据可依专业性强,即检索文献、虫部落检索网站:Google、百度、知网、万方、微信、知...

    • 11-26 21:53:53
      2023-11-26-achievements

      帮助史良老师绘制5中作物可食用部分中镉含量预测模型的准确性—-1:1图。代码如下。 import numpy as np from sklearn.metrics import mean_squar...

    • 11-08 09:45:37
      浅浅放一波好图

      日落 夜幕小猫** ...

  • 2024

    • 03-17 17:41:04
      简易kozak寻找

      一、shell命令#!/bin/bash awk '/^>/ { if (seq != "") { printf("%s\n", seq) } seq = ""; pri...

    • 03-15 08:30:16
      mute-pair

      区别单端测序、双端测序和mute-pair单端测序:即进行测序时只从序列的一端进行 双端测序:进行测序时对一条read从两端进行测序,得到正反链序列 mute-pair:在进行建库时,将染色体打断得大...

    • 03-10 18:59:03
      水稻DRE序列寻找

      1.题目 2.代码2.1 Linux shell# 分离染色体并计数每个染色体上序列数目 csplit -f rice_chromosome all.con '/>Chr/' '{*&#12...

    • 03-07 09:47:37
      水稻kozak序列的寻找

      一、kozak序列Kozak序列是位于真核生物mRNA 5’端帽子结构后面的一段核酸序列,通常是GCCACCAUGG,表达式为“[A/G]NNATGG”。它可以与翻译起始因子结合而介导含有5...

    • 02-21 20:33:15
      序列比对算法与软件

      ...

    • 02-21 20:31:31
      数据库与数据格式

      一、短序列数据库1.INSDC : International Nucleotide Sequence Database Collaboration (insdc.org)由SRA(NCBI的短序列片...

    • 02-21 20:10:39
      二代测序方式及原理

      一、illumina测序1. 基本流程1.1样本建库: ​ ①将提取的DNA通过超声波(或雾化,酶切)随机打碎成小片段,随后用DNA聚合酶补齐并添加A尾 ​ ②通过A尾将接头接上,其中...